本实用新型提供了一种拟南芥单株培养防窜粉装置，主要由螺旋广口培养盆、种子收集器、透气卷筒、卷筒盖和净化过滤膜组成。种子收集器包括种子收集杯和底座；螺旋广口培养盆通过螺纹与种子收集器的底座连接；透气卷筒下端套于种子收集器的收集杯内，透气卷筒上端与卷筒盖扣接；净化过滤膜粘贴于透气卷筒的净化过滤膜贴孔和卷筒盖的圆孔上。本实用新型一种拟南芥单株培养防窜粉装置通过在透气卷筒和卷筒盖上都贴有净化过滤膜，可以防止花粉通过，有效阻止不同单株间花粉窜粉；通过种子收集杯和底座之间保持适当的距离可以为拟南芥底部莲座叶正常生长提供一个良好的空间，有效解决了传统拟南芥种子收集装置阻碍底部莲座叶正常生长，最终影响拟南芥结果及形成种子的问题。